ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स कई प्रकार के होते हैं, और उनका वर्गीकरण भौतिक और रासायनिक गुणों, स्रोतों, अंतर्ग्रहण तंत्र और बायोमेडिकल अनुप्रयोगों पर आधारित होता है।उनके भौतिक और रासायनिक गुणों के अनुसार, झिल्ली भेदन पेप्टाइड्स को तीन प्रकारों में विभाजित किया जा सकता है: धनायनित, उभयचर और हाइड्रोफोबिक।धनायनित और एम्फीफिलिक झिल्ली मर्मज्ञ पेप्टाइड्स 85% होते हैं, जबकि हाइड्रोफोबिक झिल्ली मर्मज्ञ पेप्टाइड्स केवल 15% होते हैं।
1. धनायनित झिल्ली मर्मज्ञ पेप्टाइड
धनायनित ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स आर्जिनिन, लाइसिन और हिस्टिडीन से भरपूर छोटे पेप्टाइड्स से बने होते हैं, जैसे TAT, पेनेट्रैटिन, पॉलीअर्गिनिन, P22N, DPV3 और DPV6।उनमें से, आर्गिनिन में गुआनिडाइन होता है, जो कोशिका झिल्ली पर नकारात्मक रूप से चार्ज किए गए फॉस्फोरिक एसिड समूहों के साथ हाइड्रोजन बंधन कर सकता है और शारीरिक पीएच मान की स्थिति के तहत झिल्ली में ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स की मध्यस्थता कर सकता है।ओलिगार्जिनिन (3 आर से 12 आर तक) के अध्ययन से पता चला है कि झिल्ली प्रवेश क्षमता केवल तभी हासिल की गई थी जब आर्जिनिन की मात्रा 8 जितनी कम थी, और आर्गिनिन की मात्रा में वृद्धि के साथ झिल्ली प्रवेश क्षमता धीरे-धीरे बढ़ गई थी।लाइसिन, हालांकि आर्जिनिन की तरह धनायनित है, इसमें गुआनिडाइन नहीं होता है, इसलिए जब यह अकेले मौजूद होता है, तो इसकी झिल्ली प्रवेश दक्षता बहुत अधिक नहीं होती है।फूटाकी एट अल.(2001) में पाया गया कि अच्छा झिल्ली प्रवेश प्रभाव केवल तभी प्राप्त किया जा सकता है जब धनायनित कोशिका झिल्ली में प्रवेश करने वाले पेप्टाइड में कम से कम 8 सकारात्मक रूप से चार्ज किए गए अमीनो एसिड होते हैं।यद्यपि सकारात्मक रूप से चार्ज किए गए अमीनो एसिड अवशेष झिल्ली में प्रवेश करने के लिए मर्मज्ञ पेप्टाइड्स के लिए आवश्यक हैं, अन्य अमीनो एसिड भी उतने ही महत्वपूर्ण हैं, जैसे कि जब W14 एफ में परिवर्तित होता है, तो पेनेट्रैटिन की भेदन क्षमता खो जाती है।
धनायनित ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स का एक विशेष वर्ग परमाणु स्थानीयकरण अनुक्रम (एनएलएस) है, जिसमें आर्जिनिन, लाइसिन और प्रोलाइन से भरपूर छोटे पेप्टाइड्स होते हैं और इन्हें परमाणु छिद्र परिसर के माध्यम से नाभिक तक पहुंचाया जा सकता है।एनएलएस को आगे सिंगल और डबल टाइपिंग में विभाजित किया जा सकता है, जिसमें क्रमशः बुनियादी अमीनो एसिड के एक और दो क्लस्टर शामिल होते हैं।उदाहरण के लिए, सिमियन वायरस 40(एसवी40) से पीकेकेकेआरकेवी एक सिंगल टाइपिंग एनएलएस है, जबकि न्यूक्लियर प्रोटीन एक डबल टाइपिंग एनएलएस है।KRPAATKKAGQAKKKL वह संक्षिप्त अनुक्रम है जो झिल्ली ट्रांसमेम्ब्रेन में भूमिका निभा सकता है।क्योंकि अधिकांश एनएलएस में चार्ज संख्या 8 से कम होती है, एनएलएस प्रभावी ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स नहीं होते हैं, लेकिन जब एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स बनाने के लिए हाइड्रोफोबिक पेप्टाइड अनुक्रमों से सहसंयोजक रूप से जुड़े होते हैं, तो वे प्रभावी ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स हो सकते हैं।
2. एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड
एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स में हाइड्रोफिलिक और हाइड्रोफोबिक डोमेन होते हैं, जिन्हें प्राथमिक एम्फीफिलिक, माध्यमिक α-हेलिकल एम्फीफिलिक, β-फोल्डिंग एम्फीफिलिक और प्रोलिन-समृद्ध एम्फीफिलिक में विभाजित किया जा सकता है।
प्राथमिक प्रकार के एम्फ़िफिलिक झिल्ली पेप्टाइड्स को दो श्रेणियों में विभाजित करते हैं, एनएलएस सहसंयोजक रूप से हाइड्रोफोबिक पेप्टाइड अनुक्रम से जुड़े होते हैं, जैसे एमपीजी (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) और पेप - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), दोनों SV40 के परमाणु स्थानीयकरण संकेत PKKKRKV पर आधारित हैं, जिसमें हाइड्रोफोबिक एमपीजी का डोमेन एचआईवी ग्लाइकोप्रोटीन 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) के संलयन अनुक्रम से संबंधित है, और Pep-1 का हाइड्रोफोबिक डोमेन उच्च झिल्ली आत्मीयता (KETWWET WWTEW) के साथ ट्रिप्टोफैन समृद्ध क्लस्टर से संबंधित है।हालाँकि, दोनों के हाइड्रोफोबिक डोमेन WSQP के माध्यम से परमाणु स्थानीयकरण सिग्नल PKKKRKV से जुड़े हुए हैं।प्राथमिक एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स का एक अन्य वर्ग प्राकृतिक प्रोटीन, जैसे पीवीईसी, एआरएफ (1-22) और बीपीआरपीआर (1-28) से अलग किया गया था।
द्वितीयक α-हेलिकल एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स α-हेलिसेस के माध्यम से झिल्ली से जुड़ते हैं, और उनके हाइड्रोफिलिक और हाइड्रोफोबिक अमीनो एसिड अवशेष हेलिकल संरचना की विभिन्न सतहों, जैसे MAP (KLALKLALK ALKAALKLA) पर स्थित होते हैं।बीटा पेप्टाइड फोल्डिंग प्रकार एम्फीफिलिक पहनने वाली झिल्ली के लिए, बीटा प्लीटेड शीट बनाने की इसकी क्षमता झिल्ली की प्रवेश क्षमता के लिए महत्वपूर्ण है, जैसे कि वीटी5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) में झिल्ली की प्रवेश क्षमता पर शोध करने की प्रक्रिया में, टाइप डी का उपयोग किया जाता है। - अमीनो एसिड उत्परिवर्तन एनालॉग्स बीटा मुड़ा हुआ टुकड़ा नहीं बना सके, झिल्ली की प्रवेश क्षमता बहुत खराब है।प्रोलाइन-समृद्ध एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स में, पॉलीप्रोलाइन II (पीपीआईआई) आसानी से शुद्ध पानी में बनता है जब प्रोलाइन पॉलीपेप्टाइड संरचना में अत्यधिक समृद्ध होता है।पीपीआईआई प्रति मोड़ 3.0 अमीनो एसिड अवशेषों के साथ एक बाएं हाथ का हेलिक्स है, जो प्रति मोड़ 3.6 अमीनो एसिड अवशेषों के साथ मानक दाएं हाथ के अल्फा-हेलिक्स संरचना के विपरीत है।प्रोलाइन-समृद्ध एम्फीफिलिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स में गोजातीय रोगाणुरोधी पेप्टाइड 7 (बीएसी 7), सिंथेटिक पॉलीपेप्टाइड (पीपीआर) एन (एन 3, 4, 5 और 6 हो सकते हैं), आदि शामिल हैं।
3. हाइड्रोफोबिक झिल्ली मर्मज्ञ पेप्टाइड
हाइड्रोफोबिक ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स में केवल गैर-ध्रुवीय अमीनो एसिड अवशेष होते हैं, जिनका शुद्ध चार्ज अमीनो एसिड अनुक्रम के कुल चार्ज का 20% से कम होता है, या इसमें हाइड्रोफोबिक भाग या रासायनिक समूह होते हैं जो ट्रांसमेम्ब्रेन के लिए आवश्यक होते हैं।हालाँकि इन सेलुलर ट्रांसमेम्ब्रेन पेप्टाइड्स को अक्सर नजरअंदाज कर दिया जाता है, लेकिन वे मौजूद होते हैं, जैसे कि कपोसी के सारकोमा से फाइब्रोब्लास्ट ग्रोथ फैक्टर (K-FGF) और फाइब्रोब्लास्ट ग्रोथ फैक्टर 12 (F-GF12)।
पोस्ट समय: मार्च-19-2023