पॉलीपेप्टाइड पेप्टाइड श्रृंखला की डिजाइन योजना और समाधान

मैं. सारांश
पेप्टाइड्स विशेष मैक्रोमोलेक्यूल्स हैं जैसे कि उनका क्रम उनकी रासायनिक और भौतिक विशेषताओं में असामान्य है।कुछ पेप्टाइड्स को संश्लेषित करना कठिन होता है, जबकि अन्य को संश्लेषित करना अपेक्षाकृत आसान होता है लेकिन शुद्ध करना कठिन होता है।व्यावहारिक समस्या यह है कि अधिकांश पेप्टाइड जलीय घोल में थोड़ा घुलनशील होते हैं, इसलिए हमारे शुद्धिकरण में, हाइड्रोफोबिक पेप्टाइड के संबंधित हिस्से को गैर-जलीय सॉल्वैंट्स में भंग किया जाना चाहिए, इसलिए, इन सॉल्वैंट्स या बफर के उपयोग के साथ गंभीर रूप से असंगत होने की संभावना है जैविक प्रायोगिक प्रक्रियाओं का, ताकि तकनीशियनों को अपने स्वयं के प्रयोजनों के लिए पेप्टाइड का उपयोग करने से सख्ती से प्रतिबंधित किया जा सके, ताकि शोधकर्ताओं के लिए पेप्टाइड्स के डिजाइन के कई पहलू निम्नलिखित हों।

पॉलीपेप्टाइड पेप्टाइड श्रृंखला की डिजाइन योजना और समाधान
दूसरा, सिंथेटिक कठिन पेप्टाइड्स का सही विकल्प
1. डाउन-रेगुलेटेड अनुक्रमों की कुल लंबाई
15 से कम अवशेषों के पेप्टाइड्स प्राप्त करना आसान होता है क्योंकि पेप्टाइड का आकार बढ़ जाता है और कच्चे उत्पाद की शुद्धता कम हो जाती है।जैसे-जैसे पेप्टाइड श्रृंखला की कुल लंबाई 20 अवशेषों से अधिक बढ़ती है, सटीक उत्पाद मात्रा एक प्रमुख चिंता का विषय है।कई प्रयोगों में, अवशेष संख्या को 20 से कम करके अप्रत्याशित प्रभाव प्राप्त करना आसान है।
2. हाइड्रोफोबिक अवशेषों की संख्या कम करें
हाइड्रोफोबिक अवशेषों की एक बड़ी प्रबलता वाले पेप्टाइड्स, विशेष रूप से सी-टर्मिनस से 7-12 अवशेषों के क्षेत्र में, आमतौर पर सिंथेटिक कठिनाइयों का कारण बनते हैं।इसे अपर्याप्त संयोजन के रूप में देखा जाता है क्योंकि संश्लेषण में एक बी-फोल्ड शीट प्राप्त होती है।"ऐसे मामलों में, दो से अधिक सकारात्मक और नकारात्मक अवशेषों को परिवर्तित करना, या पेप्टाइड संरचना को अनलॉक करने के लिए पेप्टाइड में ग्लाइ या प्रो डालना उपयोगी हो सकता है।"
3. "मुश्किल" अवशेषों का डाउनरेगुलेशन
"कई Cys, Met, Arg और Try अवशेष हैं जो आमतौर पर आसानी से संश्लेषित नहीं होते हैं।"सेर का उपयोग आमतौर पर Cys के गैर-ऑक्सीडेटिव विकल्प के रूप में किया जाएगा।
पॉलीपेप्टाइड पेप्टाइड श्रृंखला की डिजाइन योजना और समाधान

तीसरा, पानी में घुलनशील का सही विकल्प सुधारें
1. एन या सी टर्मिनस को समायोजित करें
अम्लीय पेप्टाइड्स (अर्थात् पीएच 7 पर नकारात्मक चार्ज) के सापेक्ष, नकारात्मक चार्ज को बढ़ाने के लिए एसिटिलेशन (एन-टर्मिनस एसिटिलेशन, सी टर्मिनस हमेशा एक मुक्त कार्बोक्सिल समूह बनाए रखता है) की विशेष रूप से सिफारिश की जाती है।हालाँकि, बुनियादी पेप्टाइड्स (अर्थात पीएच 7 पर सकारात्मक रूप से चार्ज) के लिए, सकारात्मक चार्ज को बढ़ाने के लिए एमिनेशन (एन-टर्मिनस पर मुक्त अमीनो समूह और सी-टर्मिनस पर एमिनेशन) की विशेष रूप से सिफारिश की जाती है।

2. क्रम को बहुत छोटा या लंबा करना

कुछ अनुक्रमों में बड़ी संख्या में हाइड्रोफोबिक अमीनो एसिड होते हैं, जैसे टीआरपी, पीएचई, वैल, इले, लेउ, मेट, टायर और अला इत्यादि। जब ये हाइड्रोफोबिक अवशेष 50% से अधिक हो जाते हैं, तो इन्हें आमतौर पर भंग करना आसान नहीं होता है।पेप्टाइड के सकारात्मक और नकारात्मक ध्रुवों को और बढ़ाने के लिए अनुक्रम को लंबा करना उपयोगी हो सकता है।दूसरा विकल्प हाइड्रोफोबिक अवशेषों को कम करके सकारात्मक और नकारात्मक ध्रुवों को बढ़ाने के लिए पेप्टाइड श्रृंखला के आकार को कम करना है।पेप्टाइड श्रृंखला के सकारात्मक और नकारात्मक पक्ष जितने मजबूत होंगे, पानी के साथ प्रतिक्रिया करने की संभावना उतनी ही अधिक होगी।
3. पानी में घुलनशील अवशेष डालें
कुछ पेप्टाइड श्रृंखलाओं के लिए, कुछ सकारात्मक और नकारात्मक अमीनो एसिड का संयोजन पानी की घुलनशीलता में सुधार कर सकता है।हमारी कंपनी अम्लीय पेप्टाइड्स के एन-टर्मिनस या सी-टर्मिनस को ग्लू-ग्लू के साथ मिलाने की सिफारिश करती है।मूल पेप्टाइड का एन या सी टर्मिनस दिया गया और फिर लिस-लिस।यदि आवेशित समूह को नहीं रखा जा सकता है, तो सेर-ग्लाइ-सेर को एन या सी टर्मिनस में भी रखा जा सकता है।हालाँकि, यह दृष्टिकोण तब काम नहीं करता जब पेप्टाइड श्रृंखला के किनारों को बदला नहीं जा सकता।