डिजाइन योजना और पॉलीपेप्टाइड पेप्टाइड श्रृंखला का समाधान

I. सारांश
पेप्टाइड्स विशेष मैक्रोमोलेक्युलस ऐसे हैं जैसे कि उनके अनुक्रम उनके रासायनिक और भौतिक विशेषताओं में असामान्य हैं। कुछ पेप्टाइड्स को संश्लेषित करना मुश्किल है, जबकि अन्य अपेक्षाकृत आसान हैं, लेकिन शुद्ध करना मुश्किल है। व्यावहारिक समस्या यह है कि अधिकांश पेप्टाइड्स जलीय घोलों में थोड़ा घुलनशील होते हैं, इसलिए हमारी शुद्धि में, हाइड्रोफोबिक पेप्टाइड के संबंधित हिस्से को गैर-जलीय सॉल्वैंट्स में भंग कर दिया जाना चाहिए, इसलिए, इन सॉल्वैंट्स या बफ़र्स को जैविक प्रायोगिक प्रक्रियाओं के उपयोग से गंभीर रूप से असंगत होने की संभावना है, इसलिए कि तकनीकें शोधकर्ताओं के लिए पेप्टाइड्स का डिजाइन।

डिजाइन योजना और पॉलीपेप्टाइड पेप्टाइड श्रृंखला का समाधान
दूसरा, सिंथेटिक मुश्किल पेप्टाइड्स का सही विकल्प
1। डाउन-विनियमित अनुक्रमों की कुल लंबाई
15 से कम अवशेषों के पेप्टाइड्स को प्राप्त करना आसान होता है क्योंकि पेप्टाइड का आकार बढ़ता है और कच्चे उत्पाद की शुद्धता कम हो जाती है। चूंकि पेप्टाइड श्रृंखला की कुल लंबाई 20 अवशेषों से परे बढ़ जाती है, सटीक उत्पाद मात्रा एक महत्वपूर्ण चिंता है। कई प्रयोगों में, 20 से नीचे अवशेष संख्या को कम करके अप्रत्याशित प्रभाव प्राप्त करना आसान है।
2। हाइड्रोफोबिक अवशेषों की संख्या में कमी
हाइड्रोफोबिक अवशेषों की एक बड़ी प्रबलता वाले पेप्टाइड्स, विशेष रूप से सी-टर्मिनस से 7-12 अवशेषों के क्षेत्र में, आमतौर पर सिंथेटिक कठिनाइयों का कारण बनते हैं। यह एक अपर्याप्त संयोजन के रूप में सटीक रूप से देखा जाता है क्योंकि एक बी-गुना शीट संश्लेषण में प्राप्त की जाती है। "ऐसे मामलों में, यह दो से अधिक सकारात्मक और नकारात्मक अवशेषों को परिवर्तित करने के लिए उपयोगी हो सकता है, या पेप्टाइड रचना को अनलॉक करने के लिए पेप्टाइड में ग्लाई या प्रो को डाल सकता है।"
3। "मुश्किल" अवशेषों का डाउनग्रेडेशन
"कई Cys, met, arg, और उन अवशेषों की कोशिश कर रहे हैं जो आमतौर पर आसानी से संश्लेषित नहीं होते हैं।" SER आमतौर पर CYS के लिए एक गैर -विकल्प विकल्प के रूप में उपयोग किया जाएगा।
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तीसरा, पानी में घुलनशील की सही पसंद में सुधार करें
1। एन या सी टर्मिनस को समायोजित करें
अम्लीय पेप्टाइड्स के सापेक्ष (जो कि, पीएच 7 पर नकारात्मक रूप से चार्ज किया गया है), एसिटिलेशन (एन-टर्मिनस एसिटिलेशन, सी टर्मिनस हमेशा एक मुक्त कार्बोक्सिल समूह को बनाए रखता है) विशेष रूप से नकारात्मक चार्ज को बढ़ाने के लिए अनुशंसित है। हालांकि, बुनियादी पेप्टाइड्स के लिए (यानी, पीएच 7 पर सकारात्मक रूप से चार्ज किया गया है), एमिनेशन (एन-टर्मिनस में मुक्त एमिनो समूह और सी-टर्मिनस में एमिनेशन) को विशेष रूप से सकारात्मक चार्ज बढ़ाने के लिए सिफारिश की जाती है।

2। अनुक्रम को बहुत छोटा या लंबा करें

कुछ अनुक्रमों में बड़ी संख्या में हाइड्रोफोबिक एमिनो एसिड होते हैं, जैसे कि TRP, Phe, Val, ile, Leu, Met, Tyr और Ala, आदि। जब ये हाइड्रोफोबिक अवशेष 50%से अधिक होते हैं, तो वे आमतौर पर भंग करना आसान नहीं होते हैं। पेप्टाइड के सकारात्मक और नकारात्मक ध्रुवों को और बढ़ाने के लिए अनुक्रम को लंबा करना उपयोगी हो सकता है। दूसरा विकल्प हाइड्रोफोबिक अवशेषों को डाउनग्रेड करके सकारात्मक और नकारात्मक ध्रुवों को बढ़ाने के लिए पेप्टाइड श्रृंखला के आकार को कम करना है। पेप्टाइड श्रृंखला के सकारात्मक और नकारात्मक पक्ष जितना मजबूत होता है, उतनी ही अधिक संभावना होती है कि यह पानी के साथ प्रतिक्रिया करे।
3। पानी में घुलनशील अवशेषों में डाल दिया
कुछ पेप्टाइड श्रृंखलाओं के लिए, कुछ सकारात्मक और नकारात्मक अमीनो एसिड का संयोजन पानी की घुलनशीलता में सुधार कर सकता है। हमारी कंपनी एन-टर्मिनस या सी-टर्मिनस के अम्लीय पेप्टाइड्स की सिफारिश करती है, जिसे ग्लू-ग्लू के साथ जोड़ा जाना चाहिए। मूल पेप्टाइड का एन या सी टर्मिनस दिया गया था और फिर lys-lys। यदि चार्ज किए गए समूह को नहीं रखा जा सकता है, तो सेर-ग्लाइ-एसईआर को एन या सी टर्मिनस में भी रखा जा सकता है। हालाँकि, यह दृष्टिकोण तब काम नहीं करता है जब पेप्टाइड श्रृंखला के किनारों को बदला नहीं जा सकता है।